Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col5a3Q9JLI2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms