Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atad1Q9D5T0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad1Q9D5T0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms