Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan11Q9D1D1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms