Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm6Q3UZD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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