Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms