Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lama1P19137 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama1P19137 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms