Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rabep1O35551 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rabep1O35551 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Rabep1O35551 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rabep1O35551 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rabep1O35551 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Rabep1O35551 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabep1O35551 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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