Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms