Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4aF8VPX6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4aF8VPX6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4aF8VPX6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms