Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt71Q9R0H5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt71Q9R0H5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms