Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933402E13RikQ9D4D2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms