Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf138Q9CQE0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms