Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms