Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms