Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col10a1Q05306 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col10a1Q05306 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms