Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme1P97371 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme1P97371 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme1P97371 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms