Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhoP15409 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhoP15409 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhoP15409 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhoP15409 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhoP15409 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms