Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms