Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms