Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabep1O35551 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabep1O35551 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms