Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx7F8VPJ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx7F8VPJ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms