Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc8E9PWG2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms