Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd4A2AKM2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms