Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CtsfQ9R013 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtsfQ9R013 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsfQ9R013 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsfQ9R013 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsfQ9R013 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsfQ9R013 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsfQ9R013 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsfQ9R013 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms