Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col5a3Q9JLI2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms