Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms