Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Pdcl3Q8BVF2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Pdcl3Q8BVF2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pdcl3Q8BVF2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pdcl3Q8BVF2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Pdcl3Q8BVF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcl3Q8BVF2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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