Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms