Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms