Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme1P97371 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme1P97371 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms