Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc8a1P70414 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms