Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl9P51670 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl9P51670 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms