Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms