Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spi1P17433 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spi1P17433 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spi1P17433 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spi1P17433 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Spi1P17433 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spi1P17433 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Spi1P17433 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spi1P17433 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Spi1P17433 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Spi1P17433 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Spi1P17433 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spi1P17433 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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