Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RhoP15409 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RhoP15409 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RhoP15409 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RhoP15409 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RhoP15409 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RhoP15409 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms