Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prf1P10820 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prf1P10820 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prf1P10820 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms