Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb3P09026 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms