Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20425E9Q035 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms