Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms