Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms