Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc1Q9QZF2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms