Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Col5a3Q9JLI2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col5a3Q9JLI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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