Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms