Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms