Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms