Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Knl1Q66JQ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms