Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms