Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mre11Q61216 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms