Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc44a5Q5RJI2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc44a5Q5RJI2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms