Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uspl1Q3ULM6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uspl1Q3ULM6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms